По нынешней практике студенты, которые вступают в брак во время обучения, продолжают учебу на дневном отделении.
Если у семейного студента есть финансовые или иные возможности, то ему разрешается жить дома при условии посещения лекций и выполнения семинарских послушаний. Если таких возможностей у семейного студента нет, то он живет и учится в семинарии, но может отъезжать домой во все неучебные дни и в периоды каникул на полный срок.
Перевод на заочный сектор возможен только после хиротонии при получении архиерейского указа на приход.
Думаю, что у вас два варианта. Или не торопиться с поступлением, жениться, устроить свою семейную жизнь и затем поступать на заочное отделение.
Или поступать на очное отделение, но продумать самому и с будущей супругой, как будет строиться ваша жизнь в таких условиях.